近年全球面對大自然氣候變遷、極端氣候導致各種災害頻傳，加上臺灣南部地區每年11月至隔年5月多為枯旱型態，對於缺水風險高的南部，區域水資源經營調度壓力更形加遽，進而影響農業發展。農田水利署高雄管理處利用臺灣具前瞻性的雲端監測技術優勢，結合現地的農業灌溉管理經驗，運用物聯網技術規劃「旗山二仁導水路全線水門自動化系統建置」，期能透過中央智慧管理平台達成精進灌溉節水管理技術目標。
本自動化系統規劃以阿公店水庫上游旗山二仁導水路灌區為施設目標，藉由相關現代化監控設備之建置調節農業灌溉用水，除能排除灌溉供水作業干擾因素外，亦能減少水資源浪費及避免強降雨造成災害；利用旗山溪農業灌溉節餘的水資源，分別越域引水入南化水庫或阿公店水庫蓄存，挹注庫容，對於南部用水調度及支援扮演重要角色。
「旗山二仁導水路全線水門自動化系統建置」計畫由經濟部水利署補助經費新臺幣3,800萬元，預計自110年起至112年分3年(期)建置，目前已完成第一期「旗山二仁導水路全線水門自動化系統建置」，並於111年3月31日完成驗收。