本署於109年10月1日起成立，將農田水利會改制為本署各管理處，成為公務機關，為提升工程人員專業素養，辦理工程人員設計專班、工程採購講習及公共工程品質管理訓練班等相關講習，可充實各管理處同仁採購及工程品管專業知識，以及提升採購與品管效率與品質，並辦理研討會邀請專家、學者演講，分享各項新知識與經驗，除可增進業務承辦專業知識與技能，更可有效提升工程施工品質。
本計畫配合政府「永續農業」，宣導農田水利「三生」功能，加強各管理處工程人員水工構造物設計專業，理解水利工程中河川、水利構造物的功能作用，建立基本分析設計能力；透過各類案例，了解防洪和水資源系統規劃的理念和基本要素，並充實辦理工程採購專業人員知識，提升政府採購效率及品質，預防採購缺失之發生；利用工程實務案例解析，獲取實際工程採購經驗及技能，以利活用在實際工程採購外包工作上，藉以管控工程採購外包成本；針對工程實際問題，提供解決方案與管理技巧，以達節省工程採購成本。建立系統化之工程品質管理並訂定合理作業程序，灌輸工程人員品質管理系統之新知，以提升工程品質管理之觀念，建立工程品質管理系統，預防工程缺失之發生及提升公共工程施工品質。
111年推動成果分為三部分：
一、工程人員設計專班
辦理本署各管理處工程人員專業訓練，訓練對象以各管理處工程人員為主，課程整合農田水利工程人員所需相關技術與知識，規劃課程以工務類別為主，業於111年7月5日至7月6日辦理1梯次，共2天，參訓人員(含視訊)共計74位。
二、工程採購講習
為充實採購專業人員智識，提升政府採購效率及品質，預防採購缺失之發生，並建立採購專業人員管理制度，落實採購專業人員辦法之規定，業於111年11月29日、11月30日及12月3日辦理3梯次，每梯次1天，參訓人員共計165位。
三、公共工程品質管理訓練班
灌輸工程人員品質管理系統之新知，以提昇工程品質管理之觀念，建立工程品質管理系統、預防工程缺失之發生及提昇公共工程施工品質，辦理公共工程品質管理訓練班，業於台北、台中、高雄各辦理1梯次，共計3梯次，每梯次上課時數84小時，參訓人員共計109位。
